主动型基金由专业的基金经理进行管理，其目标是通过选取合适标的个股和把握市场时机来超越市场平均回报或者特定基准，实现获利。主动型基金所存在的缺点，如下：
1、投资成本高：主动型基金的管理费用通常高于被动型基金，因为基金经理可能需要频繁调仓来挖掘获利机会，由此导致更高的交易成本和税费。而这笔决策费用是会摊到投资者的投入成本上的。同时，由于基金独特的运作模式，无论投资者盈亏，基金公司总是能靠收手续费盈利。因此该类基金发生亏损时，投资者的不平衡心理会异常强烈。
2、持续跑赢市场很困难：尽管有些主动型基金在短期内能够取得超越市场的回报，但长期来看，大多数基金都难以持续地跑赢相应的基准指数。尤其是在整体市场低迷的大背景下，这种情况更是常见。
3、过于依赖基金经理：主动型基金能否成功很大程度上依赖于基金经理的投资能力。如果基金经理离职或表现下滑，可能对基金的业绩产生负面影响。此外，基金经理的个人风格和偏好也可能导致基金的风险暴露和收益波动性增加。
4、受制于管理者的主观性：主动型基金的业绩在很大程度上取决于基金经理的能力和市场判断。然而，市场行为复杂且难以预测。基金经理也是投资者，一样会受到市场情绪以及自身的主观行为偏差的影响，导致投资决策偏离理性分析，从而影响基金的业绩。因此，即使是所谓的明星基金经理，也难免在某些时期内无法实现超越市场的表现。
5、透明度较低：与被动型基金相比，主动型基金的持股结构和投资策略往往不那么透明。投资者可能难以准确了解基金的具体持仓和投资决策过程，这可能影响他们对基金风险和回报的评估。